バラ科サクラ属で、奈良県のサクラの名所である吉野とは関係はなく江戸中期から末期に江戸の園芸家に手によりコマツオトメとオオシマザクラの交配で誕生した園芸品種です。ソメイヨシノ同士の交配による結実しないため、接木繁殖が行われます。

サクラの代表的な品種で日本全土で広く分布しており、開花条件が気温と密接に関係していることもあり、気象庁がサクラ開花予想の指標として使用されています。

1912年3月27日に外交官だった珍田捨巳が立会い行われたワシントンのサクラ植樹には2本のソメイヨシノが含まれていました。当時植樹された3000本のうち125本が現存しており、その後も植樹が繰り返されています。